对于已经发生在巴慕达三角众多的失踪案例，以及飞机轮船驾驶人员遇到的离奇现象，有些已经被证实是自然现象导致的，通过一些已经发现的飞机及轮船残骸，科学家及调查人员归结了一下几种潜在的可以导致轮船及飞机消失的因素
失踪因素1 指南针失灵
之所以把指南失灵排在第一位，并不是它直接对飞机及轮船的神秘消失有多大影响，但在几乎所有的事故出现及离奇遭遇中，驾驶人员都曾提到他们的导航罗盘失灵，这也间接地影响他们在自然环境中失去方向，进而让自己处于迷失的危险之中，尤其是飞机驾驶人员，在茫茫的大海之中，一旦失去方向，就可能一直偏离陆地，最后然后耗尽就只能迫降于大海之中，在加之上世纪初没有全球定位系统及电子求解信号，在大海中的地毯式搜索几乎等同于大海捞针，如果再遇到特殊的风浪极端天气，海面的飞机和漂浮人员会很快沉入大海，瞬间消失，但究竟是什么原因导致罗盘失灵，一个最直接的原因就是该地区地球磁场的异常,
指南针与磁极有天然的磁变化，这是航海家几个世纪前就知道的事实。磁(罗盘)北和地理(真)北只有在少数地方是完全相同的——例如，在2000年，在美国，只有从威斯康辛州到墨西哥湾的铁路线上的那些地方是完全相同的，但公众可能并不知道这一现象，他们认为指南针在像百慕大三角这样大的区域“改变”是很神秘的，事实上在地球的一些区域，磁场是会自然改变的，但这一普通自然现象对于有经验的驾驶人员的影响是微不足道的，很多奇特遭遇中提到的罗盘不是轻微的角度变化而是在一直转圈，说明该地区磁场变化是剧烈的，剧烈到驾驶人员无法根据自己的经验和客观外部环境来判断方位，
事实上在南大西洋上空，科学家们早就发现了该地区确实存在一个磁场异常带，学术名称南大西洋异常带(South Atlantic Anomaly，SAA)，在地球物理学中，地球有两个范艾伦带Van Allen belts ,即一对甜甜圈形状的带电粒子环，围绕着我们的星球，它被地球磁场固定在原地。内部主要由高能质子组成，外部主要由电子组成。因为辐射带能捕获从太阳表面发射出来的粒子，所以它们最终保护了地球表面免受有害辐射的伤害。然而，在大西洋的个别位置，太阳宇宙射线的粒子并没有像它们在地球上的其他地方那样被阻挡。在那个地区，由地球及其磁偶极子的非同心性导致的该地区形成最弱地球磁场，较低的地磁场强度最终导致卫星更容易受到高能粒子的攻击，以至于航天器在穿越该地区时可能会受损，而地表附近相应地经常出现剧烈的磁场变化。
失踪因素2 极端天气
突发性的极端天气很可能是造成百慕大三角众多离奇失踪案的主要原因，百慕大三角本就处于热带水域，这种环境下极易形成强大的风暴，这一地球也是东大西洋飓风的主要形成地，飓风也造成美国东南部地区每年上千人的伤亡和数十亿美元的损失，这其中当然包括船只和飞机的失事，但这多发于上世纪中期之前，全球气象卫星和导航预警系统的普及，已经大大避免了事故的发生，但在一个世纪之前，海上风暴造成了大量船只的损毁和沉没，1502年弗朗西斯科·德·波巴迪拉(Francisco de Bobadilla)的西班牙舰队沉没是有记载的第一次破坏性飓风。这些风暴在过去造成了许多与三角有关的事件。
许多大西洋飓风在离开东海岸时经过百慕大三角，在气象卫星出现之前，船只通常很少或根本没有飓风接近的警告，当然除了飓风之类的热带气旋，海上的突发特殊天气还有很多种，即使在现今也会造成损失，一股强大的冷空气下沉被怀疑是1986年5月14日巴尔的摩骄傲号沉没的原因。沉船上的船员注意到风向突然转变，风速从32公里/小时(20英里/小时)增加到97-145公里/小时(60-90英里/小时)。国家飓风中心的卫星专家詹姆斯·卢辛说:“在非常不稳定的天气条件下，来自高空的冷空气会像炸弹一样击中地面，像巨大的风和水的飑线一样向外爆炸。
失踪因素3 墨西哥湾流
墨西哥湾流(佛罗里达流)是一种主要的地表流，由热盐环流驱动，它起源于墨西哥湾，然后流经佛罗里达海峡进入北大西洋。从本质上讲，它是海洋中的一条河流，就像河流一样，它可以也确实携带着漂浮物。它的最大表面速度约为2米/秒(6.6英尺/秒)。一架在水上迫降的小飞机或一艘发动机出现故障的船都可能被这种海洋中的水流冲走，因此偏离了之前失事时报告的位置，导致救援人员没法及时发现他们，但墨西哥湾流是能算事故中飞机轮船神秘消失的辅助性因素，而非直接或主要诱因
失踪因素4 甲烷水合物
甲烷水合物在海洋中形成的巨大气泡群导致沉船这一理论，是在近些年来才逐渐被人所熟知的。海洋大陆架上存在的大量甲烷水合物是一种特殊的天然气，在澳大利亚进行的实验室实验已经证明，气泡确实可以通过降低水的密度而使一艘比例模型船沉没，任何残骸都会沉积在海底或被墨西哥湾流迅速驱散。据推测，周期性的甲烷喷发，有时被称为“泥火山”可能会产生泡沫水区域，这些区域不再能够为船只提供足够的浮力。如果是这样的话，在一艘船周围形成的这样一个区域可能会导致它在没有任何警告的情况下迅速沉没。美国地质勘探局的出版物描述了世界范围内大量的海底水合物，包括美国东南部海岸外的布莱克岭地区。然而，据美国地质勘探局称，在过去的15000年里，百慕大三角没有发生过大规模的天然气水合物释放
失踪因素5 人为原因
事实上在全球范围内官方对飞机或船只失事的调查中，被引用最多的解释之一是人为失误。就拿上期节目中提到的美国海军失踪的去9号飞行编队为例，罗盘的失灵可能对飞行造成一定的麻烦，但一个有经验的飞行员也一定具备在罗盘失灵情况下，白天通过太阳，晚上通过星星来进行自然界标的物的人为导航能力，但就该起事故，美国海军调查委员会曾在事故报告中明确指出，飞行队长查尔斯·c·泰勒(Charles C. Taylor)中尉错误地认为，他飞过的小岛是佛罗里达群岛，他的飞行是在墨西哥湾上空，向东北飞行会把他们带到佛罗里达。经确认，泰勒按计划飞越了巴哈马群岛，但他的确在大西洋上空引导他的飞机向东北方向飞行。报告指出，一些下级军官很可能知道他们的大致位置，因为无线电广播显示，向西飞行可以到达大陆。但正如报告中所指出的那样，因为他担心古巴无线电台的干扰，泰勒曾拒绝将无线电训练频率改为搜索和救援无线电频率，导致最终飞机失去和地面的联系。
除了以上几条目前科学水平范畴内的因素，还有一些则是目前没法证实的牵扯到超自然现象的解释，甚至还有学者将其和传说中的史前文明联系在一起，目前流传的牵扯到百慕大的神秘现象的超自然理论主要有三条
神秘理论1–电子雾
上期已经解释了一种可能触发奇特遭遇中电子雾的成因之一，即大气环境中形成的一种自然现象圣埃尔莫之火，但这一现象也仅仅能解释一部分情况，而奇观电子雾不仅具备带一定的电磁性，它还可以迅速地变化形状，呈现固态特征，并呈现一定的大气层中的漩涡隧道特点，而最重要的一个特点，就在布鲁斯的那段离奇经历中。它的飞行事件的答复缩短，事后他推算，在飞机飞入那个奇观的隧道后，到最后飞出这三分钟内飞行了150公里，即飞机速度提高到每小时3000公里，这是不可能的。这个速度比当时最快的战斗机还要快，还有一种理论认为云层卷起的并充满电时，可以快速移动并推动异物前进，它们有能力产生强大的磁场，影响飞机的导航系统，但这一理论至今尚未得到证实。即使因为某些特殊原因让飞机达到这种速度，布鲁斯格农驾驶的小型旋翼飞机的机体构造条件也不允许，估计早就散架了，还有一种超自然的解释就是这种电子雾是在时空扭曲时伴随产生的一种空间发电现象，这就引出了时空扭曲理论或者虫洞现象
神秘理论2–时空扭曲time warp或虫洞wormhole
在爱因斯坦没有发表相对论之前，主流学界一直认为时间和空间这俩个因素看成是永恒不变的，并停留在牛顿对地球引力的解释，但爱因斯告诉我们地球和其他星体并不是真的存在什么引力，而是因为巨大的质量物体将周围的空间扭曲造成的，物理学界才真正迈出经典物理学的界限，来以相对和变化的眼光看到一切事物，包括时间，空间和光，其中我们看不着摸不着的空间也是可以改变的，如果把三维的空间看做作一张二维的A4纸，飞机从地表空间中的一个地理位置飞到另外一个地理位置，可是看成在A4纸上的一个点画一条线到纸上的另外一个点，在空间或平面中两点的直线距离也是最短的，但现对论告诉我们两点之间可以没有距离，将两个位置所在的空间扭曲折叠进而将两点重叠在一起就OK了，这就好比将A4纸折叠，将纸上两点重叠在一起一样。用一只铅笔将重叠后的俩点穿一个孔，任何穿过这个孔的物体，在物理层面的纸张上也就相当于从纸上的一点到达另外一点，
有人认为布鲁斯格农驾驶的飞机就是偶然进入了这个类似空的的时空隧道当中，因此在几分钟内跨越了数百英里的距离，这种孔洞在物理学中被称为虫洞，是爱因斯坦及纳森·罗森在研究引力场方程时假设的，认为透过虫洞可以做瞬时的空间转移或者做时间旅行，“虫洞”就是连接宇宙遥远区域间的时空细管。理论上，虫洞是连结两个遥远时空的空间隧道，就像是大海里面的漩涡，是无处不在但转瞬即逝的，这些时空漩涡是由星体旋转和引力作用共同造成的，就像漩涡能够让局部水面跟水底离得更近一样，能够让两个相对距离很远的局部空间瞬间离得很近。遗憾的是到目前为止，虫洞还没有被观测到，而布鲁斯格农的飞机是否就是进入了旋转云层中的时空虫洞，目前没法证实，他们的手表和飞机的时钟变慢了半个小时可能就是唯一的间接证据。或许那些到目前还没有踪迹的消失飞机和舰船真的被卷入虫洞到达了另外一个遥远的空间也说不定。
神秘理论3.亚特兰蒂斯所在地
亚特兰蒂斯是古希腊哲学家柏拉图在公元前360年的对话录《蒂迈乌斯Timaeus》和《克里提亚斯Critias》中提到的一个史前文明，亚特兰蒂斯被描述为一个海军帝国，统治着已知世界的所有西部地区，据传是一次巨大的地震及海啸将其淹没于海底，在他之后的两千多年内一直被各个时期的各种文献所描述，直到今日历史学家和考古学家一直在世界各地寻找它的遗迹，但很遗憾，到目前为止还没任何线索，甚至很多学者人质疑柏拉图扣子叙述的这个亚特兰蒂斯是否真的存在过，一些调查人员曾根据柏拉图对亚特兰蒂斯地形分布及位置的描述，列举了世界上几个可能作为亚特兰蒂斯，其中地中海及北欧的几个地区都曾被列为潜在对象，在远一点就是大西洋的几个岛屿，甚至南极都在在这个名单之中，而百慕大地区作为潜在的亚特兰蒂斯的沉没地，和其他几个热门地区先比。排名不不靠前，而第一次提出百慕达三角地区是亚特兰蒂斯所在地这一观点，还仅仅是50年前的事情。
美国作家查尔斯·伯利茨(Charles Berlitz)在他1974年出版的畅销书《百慕大三角》中首次提出的亚特兰蒂斯沉没于百慕大，从那以后，成千上万的书籍、杂志、电视节目和网站都在宣传这个理论推断，一些作家扩展了伯利茨关于亚特兰蒂斯的观点，认为这座神话般的城市可能位于海底，并利用其著名的“水晶能量”击沉船只和飞机。其他更离奇的说法包括时空索道说和水下外星人基地，曾有学者将发现于巴哈马群岛比米尼岛附近被称为比米尼路的水下岩层作为亚特兰蒂斯存在的间接证据，它被飞行员及考古队发现于1968年，这段由规则巨石组成的绵延一英里的构造被认为是亚特兰蒂斯沉没遗址的一部分，而巧合的是著名的预言家埃德加·凯西(Edgar Cayce)曾预言亚特兰蒂斯的证据将在1968年被发现，但到目前为止学界对于比米尼路是否是人造建筑还在争论之中，所以说将其作为亚特兰蒂斯存在的证据未免有些牵强
事实是，地质学完全否定了这百慕大地区存在沉没陆地的观点。随着大陆漂移在20世纪60年代被广泛接受，板块构造学证明，在人类历史上，大块陆地不可能沉入海底，因为它无处可去:海底是随着时间的推移而扩展的，而不是收缩的。此外，《自然历史》杂志指出，迄今为止还没有测量到足以使一块大陆下沉的地震。即使是1906年历史性的旧金山地震也只产生了大约22英尺的相对运动，几乎不足以将其置于海底。那百慕大地区是否可能存在沉没的岛屿呢？这个观点到时在理论上是可能的，毕竟一些火山岛的沉没与形成很可能就是短时间内的事情，这种现象在海洋地质构造的过程中也很常见，但鉴于水下考古挖掘的难度和目前已知的百慕大地区的海底构造特征，还没有证据显示之前在此地存在一个大的岛屿并沉没于海底，或者随着水下考古的持续进行，在未来的某天有什么突破性的发现也说不定，我们拭目以待。